Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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ATG16L1Q676U5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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ATG16L1Q676U5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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ATG16L1Q676U5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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ATG16L1Q676U5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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ATG16L1Q676U5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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ATG16L1Q676U5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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ATG16L1Q676U5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG16L1Q676U5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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