Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF8Q5VWM4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms