Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF20Q5VT98 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms