Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms