Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms