Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H13Q5T200 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H13Q5T200 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms