Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms