Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms