Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms