Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms