Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP29Q52LW3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms