Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms