Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXO43Q4G163 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXO43Q4G163 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms