Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms