Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms