Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEACAM16Q2WEN9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms