Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms