Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
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