Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDR2Q16832 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDR2Q16832 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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