Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPROQ16827 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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