Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
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