Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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