Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SF1Q15637 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SF1Q15637 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SF1Q15637 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SF1Q15637 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SF1Q15637 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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