Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUM3Q15397 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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