Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms