Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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