Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRCAPQ14761 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRCAPQ14761 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPRCAPQ14761 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAPQ14761 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRCAPQ14761 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRCAPQ14761 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRCAPQ14761 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRCAPQ14761 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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