Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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UBE4AQ14139 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE4AQ14139 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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