Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBFBQ13951 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms