Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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