Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPP1R1AQ13522 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.6 ms