Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCIRG1Q13488 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TCIRG1Q13488 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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