Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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