Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATMQ13315 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATMQ13315 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATMQ13315 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATMQ13315 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATMQ13315 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATMQ13315 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATMQ13315 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATMQ13315 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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