Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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