Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME3Q13232 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME3Q13232 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME3Q13232 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME3Q13232 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME3Q13232 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME3Q13232 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME3Q13232 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME3Q13232 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME3Q13232 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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