Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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TRAF1Q13077 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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