Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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