Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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