Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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PTPRJQ12913 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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