Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TROQ12816 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TROQ12816 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TROQ12816 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TROQ12816 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TROQ12816 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TROQ12816 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TROQ12816 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TROQ12816 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TROQ12816 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TROQ12816 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TROQ12816 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TROQ12816 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TROQ12816 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TROQ12816 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TROQ12816 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TROQ12816 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TROQ12816 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TROQ12816 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TROQ12816 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TROQ12816 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TROQ12816 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
TROQ12816 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms