Protein–RNA interactions for Protein: Q12386

ARP8, Actin-like protein ARP8, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP8Q12386 FKS1YLR342W 5631 nt2.21□□□□□ -2.06
ARP8Q12386 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.2□□□□□ -2.06
ARP8Q12386 PEP1YBL017C 4740 nt2.19□□□□□ -2.06
ARP8Q12386 DNF3YMR162C 4971 nt2.17□□□□□ -2.06
ARP8Q12386 CAT8YMR280C 4302 nt2.12□□□□□ -2.07
ARP8Q12386 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt2.11□□□□□ -2.07
ARP8Q12386 YGR130CYGR130C 2451 nt2.1□□□□□ -2.07
ARP8Q12386 FYV8YGR196C 2454 nt2.09□□□□□ -2.07
ARP8Q12386 SPT7YBR081C 3999 nt2.08□□□□□ -2.08 RIP-Chip
ARP8Q12386 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.08□□□□□ -2.08
ARP8Q12386 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt2.07□□□□□ -2.08
ARP8Q12386 YER090C-AYER090C-A 90 nt2.05□□□□□ -2.08
ARP8Q12386 PET111YMR257C 2403 nt1.99□□□□□ -2.09
ARP8Q12386 SPC110YDR356W 2835 nt1.99□□□□□ -2.09
ARP8Q12386 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.98□□□□□ -2.09
ARP8Q12386 VPS15YBR097W 4365 nt1.96□□□□□ -2.1
ARP8Q12386 SSK2YNR031C 4740 nt1.95□□□□□ -2.1
ARP8Q12386 BRR2YER172C 6492 nt1.95□□□□□ -2.1
ARP8Q12386 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.93□□□□□ -2.1
ARP8Q12386 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.89□□□□□ -2.11
ARP8Q12386 MLP2YIL149C 5040 nt1.82□□□□□ -2.12
ARP8Q12386 MEC1YBR136W 7107 nt1.81□□□□□ -2.12
ARP8Q12386 CCH1YGR217W 6120 nt1.8□□□□□ -2.12
ARP8Q12386 YPR117WYPR117W 7470 nt1.79□□□□□ -2.12
ARP8Q12386 snR67snR67 82 nt1.79□□□□□ -2.12
ARP8Q12386 VAM6YDL077C 3150 nt1.79□□□□□ -2.12 RIP-Chip
ARP8Q12386 IRA1YBR140C 9279 nt1.77□□□□□ -2.13
ARP8Q12386 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.73□□□□□ -2.13
ARP8Q12386 RKR1YMR247C 4689 nt1.71□□□□□ -2.14
ARP8Q12386 PAU24YBR301W 363 nt1.7□□□□□ -2.14
ARP8Q12386 IML1YJR138W 4755 nt1.68□□□□□ -2.14
ARP8Q12386 HKR1YDR420W 5409 nt1.65□□□□□ -2.15
ARP8Q12386 LTE1YAL024C 4308 nt1.64□□□□□ -2.15
ARP8Q12386 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.63□□□□□ -2.15
ARP8Q12386 SCC2YDR180W 4482 nt1.62□□□□□ -2.15
ARP8Q12386 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.61□□□□□ -2.15
ARP8Q12386 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.59□□□□□ -2.15 RIP-Chip
ARP8Q12386 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.58□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.58□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.58□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.58□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.58□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.58□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.58□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.58□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 MYO1YHR023W 5787 nt1.58□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 BUD3YCL014W 4911 nt1.57□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.56□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 YMR160WYMR160W 2451 nt1.55□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.54□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.54□□□□□ -2.16
ARP8Q12386 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.52□□□□□ -2.17
ARP8Q12386 DOP1YDR141C 5097 nt1.47□□□□□ -2.17
ARP8Q12386 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.41□□□□□ -2.18
ARP8Q12386 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.41□□□□□ -2.18
ARP8Q12386 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.41□□□□□ -2.18
ARP8Q12386 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.41□□□□□ -2.18
ARP8Q12386 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.41□□□□□ -2.18
ARP8Q12386 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.41□□□□□ -2.18
ARP8Q12386 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.41□□□□□ -2.18
ARP8Q12386 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.41□□□□□ -2.18
ARP8Q12386 UTP20YBL004W 7482 nt1.39□□□□□ -2.19
ARP8Q12386 IQG1YPL242C 4488 nt1.36□□□□□ -2.19
ARP8Q12386 MLP1YKR095W 5628 nt1.33□□□□□ -2.2
ARP8Q12386 BEM2YER155C 6504 nt1.3□□□□□ -2.2
ARP8Q12386 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.24□□□□□ -2.21
ARP8Q12386 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.23□□□□□ -2.21
ARP8Q12386 YJR029WYJR029W 5268 nt1.22□□□□□ -2.21
ARP8Q12386 snR40snR40 97 nt1.21□□□□□ -2.22
ARP8Q12386 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.19□□□□□ -2.22
ARP8Q12386 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.19□□□□□ -2.22
ARP8Q12386 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.19□□□□□ -2.22
ARP8Q12386 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.19□□□□□ -2.22
ARP8Q12386 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.19□□□□□ -2.22
ARP8Q12386 YOL014WYOL014W 375 nt1.19□□□□□ -2.22
ARP8Q12386 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.17□□□□□ -2.22
ARP8Q12386 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt1.14□□□□□ -2.23
ARP8Q12386 snR77snR77 88 nt1.1□□□□□ -2.23
ARP8Q12386 ESP1YGR098C 4893 nt1.07□□□□□ -2.24
ARP8Q12386 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.04□□□□□ -2.24
ARP8Q12386 SOV1YMR066W 2697 nt1.02□□□□□ -2.25
ARP8Q12386 SBH2YER019C-A 267 nt1□□□□□ -2.25
ARP8Q12386 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.9□□□□□ -2.27
ARP8Q12386 YJL113WYJL113W 4647 nt0.83□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.81□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.81□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.81□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.81□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.81□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 THO2YNL139C 4794 nt0.79□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 UTP10YJL109C 5310 nt0.78□□□□□ -2.28
ARP8Q12386 FMP27YLR454W 7887 nt0.78□□□□□ -2.29
ARP8Q12386 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.7□□□□□ -2.3
ARP8Q12386 PAU9YBL108C-A 129 nt0.66□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 79.8 ms