Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 PEP1YBL017C 4740 nt1.86□□□□□ -2.11
TFB4Q12004 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.85□□□□□ -2.11
TFB4Q12004 LAA1YJL207C 6045 nt1.83□□□□□ -2.12
TFB4Q12004 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.83□□□□□ -2.12
TFB4Q12004 FYV8YGR196C 2454 nt1.81□□□□□ -2.12
TFB4Q12004 BRR2YER172C 6492 nt1.81□□□□□ -2.12
TFB4Q12004 VPS15YBR097W 4365 nt1.81□□□□□ -2.12
TFB4Q12004 EST2YLR318W 2655 nt1.81□□□□□ -2.12
TFB4Q12004 PET111YMR257C 2403 nt1.8□□□□□ -2.12
TFB4Q12004 MEC1YBR136W 7107 nt1.75□□□□□ -2.13
TFB4Q12004 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.73□□□□□ -2.13
TFB4Q12004 IRA1YBR140C 9279 nt1.72□□□□□ -2.13
TFB4Q12004 NUP192YJL039C 5052 nt1.72□□□□□ -2.13
TFB4Q12004 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.72□□□□□ -2.13
TFB4Q12004 YGR130CYGR130C 2451 nt1.71□□□□□ -2.14
TFB4Q12004 SSK2YNR031C 4740 nt1.7□□□□□ -2.14
TFB4Q12004 FIG2YCR089W 4830 nt1.7□□□□□ -2.14
TFB4Q12004 CLU1YMR012W 3834 nt1.69□□□□□ -2.14
TFB4Q12004 CAT8YMR280C 4302 nt1.67□□□□□ -2.14
TFB4Q12004 MYO1YHR023W 5787 nt1.65□□□□□ -2.15
TFB4Q12004 SPT7YBR081C 3999 nt1.64□□□□□ -2.15
TFB4Q12004 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.6□□□□□ -2.15
TFB4Q12004 SPC110YDR356W 2835 nt1.56□□□□□ -2.16
TFB4Q12004 snR67snR67 82 nt1.54□□□□□ -2.16
TFB4Q12004 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.52□□□□□ -2.17
TFB4Q12004 BUD3YCL014W 4911 nt1.49□□□□□ -2.17
TFB4Q12004 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TFB4Q12004 CCH1YGR217W 6120 nt1.49□□□□□ -2.17
TFB4Q12004 RKR1YMR247C 4689 nt1.48□□□□□ -2.17
TFB4Q12004 VAM6YDL077C 3150 nt1.48□□□□□ -2.17
TFB4Q12004 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.46□□□□□ -2.18
TFB4Q12004 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.4□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 HKR1YDR420W 5409 nt1.39□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.37□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.37□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.36□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.36□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.36□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.36□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.36□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.36□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.36□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 YPR117WYPR117W 7470 nt1.36□□□□□ -2.19
TFB4Q12004 YMR160WYMR160W 2451 nt1.33□□□□□ -2.2
TFB4Q12004 MLP2YIL149C 5040 nt1.29□□□□□ -2.2
TFB4Q12004 SCC2YDR180W 4482 nt1.28□□□□□ -2.2
TFB4Q12004 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.25□□□□□ -2.21
TFB4Q12004 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.25□□□□□ -2.21
TFB4Q12004 PAU24YBR301W 363 nt1.25□□□□□ -2.21
TFB4Q12004 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.23□□□□□ -2.21
TFB4Q12004 IML1YJR138W 4755 nt1.21□□□□□ -2.22
TFB4Q12004 LTE1YAL024C 4308 nt1.18□□□□□ -2.22
TFB4Q12004 snR40snR40 97 nt1.15□□□□□ -2.23
TFB4Q12004 DOP1YDR141C 5097 nt1.09□□□□□ -2.24
TFB4Q12004 YJR029WYJR029W 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
TFB4Q12004 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
TFB4Q12004 MLP1YKR095W 5628 nt1.02□□□□□ -2.25
TFB4Q12004 BEM2YER155C 6504 nt1.01□□□□□ -2.25
TFB4Q12004 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.01□□□□□ -2.25
TFB4Q12004 snR77snR77 88 nt0.99□□□□□ -2.25
TFB4Q12004 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.99□□□□□ -2.25
TFB4Q12004 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
TFB4Q12004 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
TFB4Q12004 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
TFB4Q12004 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
TFB4Q12004 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.99□□□□□ -2.25
TFB4Q12004 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.94□□□□□ -2.26
TFB4Q12004 SBH2YER019C-A 267 nt0.9□□□□□ -2.27
TFB4Q12004 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.89□□□□□ -2.27
TFB4Q12004 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.89□□□□□ -2.27
TFB4Q12004 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.89□□□□□ -2.27
TFB4Q12004 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
TFB4Q12004 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
TFB4Q12004 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.89□□□□□ -2.27
TFB4Q12004 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
TFB4Q12004 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
TFB4Q12004 THO2YNL139C 4794 nt0.86□□□□□ -2.27
TFB4Q12004 SOV1YMR066W 2697 nt0.82□□□□□ -2.28
TFB4Q12004 IQG1YPL242C 4488 nt0.8□□□□□ -2.28
TFB4Q12004 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.77□□□□□ -2.29
TFB4Q12004 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.75□□□□□ -2.29
TFB4Q12004 YOL014WYOL014W 375 nt0.75□□□□□ -2.29
TFB4Q12004 UTP10YJL109C 5310 nt0.74□□□□□ -2.29
TFB4Q12004 ESP1YGR098C 4893 nt0.73□□□□□ -2.29
TFB4Q12004 UTP20YBL004W 7482 nt0.7□□□□□ -2.3
TFB4Q12004 PAU9YBL108C-A 129 nt0.68□□□□□ -2.3
TFB4Q12004 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
TFB4Q12004 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.65□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.65□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.65□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.65□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.65□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 snR128snR128 126 nt0.6□□□□□ -2.31
TFB4Q12004 FMP27YLR454W 7887 nt0.55□□□□□ -2.32
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