Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms