Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms