Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCBP1Q09161 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCBP1Q09161 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms