Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms