Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DQ08499 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms