Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 GLG1YKR058W 1851 nt1.12□□□□□ -2.23
SGO1Q08490 SEC10YLR166C 2616 nt1.12□□□□□ -2.23
SGO1Q08490 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.12□□□□□ -2.23
SGO1Q08490 SCC2YDR180W 4482 nt1.1□□□□□ -2.23
SGO1Q08490 BEM2YER155C 6504 nt1.1□□□□□ -2.23
SGO1Q08490 ULP2YIL031W 3105 nt1.1□□□□□ -2.23
SGO1Q08490 DOP1YDR141C 5097 nt1.1□□□□□ -2.23
SGO1Q08490 snR62snR62 100 nt1.08□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 RPS26AYGL189C 360 nt1.08□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 UTP20YBL004W 7482 nt1.07□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 RKR1YMR247C 4689 nt1.07□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 YOL014WYOL014W 375 nt1.07□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.05□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.05□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.05□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.05□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.04□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 YJR029WYJR029W 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 YPR117WYPR117W 7470 nt1.03□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 EST1YLR233C 2100 nt1.03□□□□□ -2.24
SGO1Q08490 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.02□□□□□ -2.25
SGO1Q08490 CSE1YGL238W 2883 nt1.02□□□□□ -2.25
SGO1Q08490 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.01□□□□□ -2.25
SGO1Q08490 snR69snR69 101 nt0.99□□□□□ -2.25
SGO1Q08490 NIP1YMR309C 2439 nt0.97□□□□□ -2.25
SGO1Q08490 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.97□□□□□ -2.25
SGO1Q08490 BUL2YML111W 2763 nt0.97□□□□□ -2.25
SGO1Q08490 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.96□□□□□ -2.25
SGO1Q08490 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.96□□□□□ -2.26
SGO1Q08490 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.96□□□□□ -2.26
SGO1Q08490 LTE1YAL024C 4308 nt0.95□□□□□ -2.26
SGO1Q08490 YMR160WYMR160W 2451 nt0.93□□□□□ -2.26
SGO1Q08490 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.92□□□□□ -2.26
SGO1Q08490 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.92□□□□□ -2.26
SGO1Q08490 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.92□□□□□ -2.26
SGO1Q08490 snR47snR47 99 nt0.92□□□□□ -2.26
SGO1Q08490 RDS3YPR094W 324 nt0.91□□□□□ -2.26
SGO1Q08490 ORC3YLL004W 1851 nt0.9□□□□□ -2.26
SGO1Q08490 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.85□□□□□ -2.27
SGO1Q08490 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.84□□□□□ -2.27
SGO1Q08490 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.84□□□□□ -2.27
SGO1Q08490 IQG1YPL242C 4488 nt0.82□□□□□ -2.28
SGO1Q08490 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.82□□□□□ -2.28
SGO1Q08490 PET111YMR257C 2403 nt0.8□□□□□ -2.28
SGO1Q08490 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.79□□□□□ -2.28
SGO1Q08490 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.75□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 snR50snR50 90 nt0.73□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 MLP1YKR095W 5628 nt0.73□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.72□□□□□ -2.29
SGO1Q08490 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.71□□□□□ -2.3
SGO1Q08490 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.7□□□□□ -2.3
SGO1Q08490 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.7□□□□□ -2.3
SGO1Q08490 snR64snR64 101 nt0.68□□□□□ -2.3
SGO1Q08490 YKL225WYKL225W 348 nt0.68□□□□□ -2.3
SGO1Q08490 RPL41AYDL184C 78 nt0.67□□□□□ -2.3
SGO1Q08490 FMP27YLR454W 7887 nt0.67□□□□□ -2.3
SGO1Q08490 snR38snR38 95 nt0.65□□□□□ -2.31
SGO1Q08490 AI1Q0050 2505 nt0.65□□□□□ -2.31
SGO1Q08490 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.64□□□□□ -2.31
SGO1Q08490 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.63□□□□□ -2.31
SGO1Q08490 snR53snR53 91 nt0.62□□□□□ -2.31
SGO1Q08490 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
SGO1Q08490 MLP2YIL149C 5040 nt0.55□□□□□ -2.32
SGO1Q08490 snR67snR67 82 nt0.54□□□□□ -2.32
SGO1Q08490 ESP1YGR098C 4893 nt0.54□□□□□ -2.32
SGO1Q08490 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.52□□□□□ -2.33
SGO1Q08490 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.51□□□□□ -2.33
SGO1Q08490 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.48□□□□□ -2.33
SGO1Q08490 THO2YNL139C 4794 nt0.47□□□□□ -2.33
SGO1Q08490 SKI7YOR076C 2244 nt0.44□□□□□ -2.34
SGO1Q08490 SOV1YMR066W 2697 nt0.41□□□□□ -2.34
SGO1Q08490 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.38□□□□□ -2.35
SGO1Q08490 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.35□□□□□ -2.35
SGO1Q08490 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.32□□□□□ -2.36
SGO1Q08490 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.3□□□□□ -2.36
SGO1Q08490 snR128snR128 126 nt0.27□□□□□ -2.37
SGO1Q08490 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.26□□□□□ -2.37
SGO1Q08490 PAU9YBL108C-A 129 nt0.16□□□□□ -2.38
SGO1Q08490 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.15□□□□□ -2.39
SGO1Q08490 YJL113WYJL113W 4647 nt0.11□□□□□ -2.39
SGO1Q08490 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.11□□□□□ -2.39
SGO1Q08490 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.09□□□□□ -2.4
SGO1Q08490 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.04□□□□□ -2.4
SGO1Q08490 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.02□□□□□ -2.41
SGO1Q08490 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.01□□□□□ -2.41
SGO1Q08490 SBH2YER019C-A 267 nt-0.06□□□□□ -2.42
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