Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP1Q07960 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP1Q07960 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms